甄嬛发现孟静娴的孩子身上带有青斑，想起宫中传说先纯元皇后之子生下便夭折，身上也有青斑，请来敬贵妃共查此事。皇帝命人彻查皇后宫中所有宫女太监，苏培盛从一干人口中得知皇后此前蓄意谋害甄嬛等多项罪名，并迁出皇后陷害纯元皇后身亡的重大秘密。当年，宜修入王府为侧福晋，不久后怀孕，只待生下王子即可册封为嫡福晋，偏偏此时她嫡出的姐姐柔则入府伺候，被皇帝一眼看中，执意娶为福晋。宜修口头答应，但心内怨恨，身心俱损，生下的大阿哥弘暄胎里不足，三岁夭亡。大阿哥死去当天，宜修悲愤交加，偏偏柔则此时有了身孕，皇帝只顾柔则有孕而忽视了宜修的丧子之痛。宜修表面上侍奉姐姐十分殷勤，暗中却在其膳食中用了大量的芭蕉、桃仁等伤胎之物。柔则身体百般不适，早产生下一个死胎后便不幸去世，宜修的罪行也被一名曾冲撞柔则的侧福晋背了黑锅。宜修这才成为福晋，却也再也没能生育。皇帝即位后追封柔则为纯元皇后。
皇帝意欲废后，皇后承认自己的种种罪行，哭诉自己之所以为之，完全是因为太爱皇帝，不愿与任何女人共享皇帝的宠爱，因而痛恨姐姐。孙姑姑急忙送来太后先所立遗诏，不准废后，皇帝碍于纯元皇后的情面，下旨与皇后乌拉那拉·宜修死生不复相见，收回其金册、金宝，终身禁足于景仁宫。准噶尔可汗摩格觐见，席间认出甄嬛，想起昔日此女子曾在山上搭救自己之事，欲夺甄嬛。摩格奉上一串九连玉环欲为难大清皇帝及众臣，众人或是不知，或是知道方法而没办法做，却被甄嬛巧施一计，教导女儿胧月以孩童无知为由，破玉解密，摩格大扫颜面。岳钟琪偷袭准噶尔得手，皇帝以甄嬛之计在准噶尔军队中散布时疫削弱其兵力。